Pendidikan Tinggi Kristen di Indonesia dikenal melalui jalur Pendidikan seperti di Universitas, Sekolah Tinggi Teologi, STAK (Sekolah Tinggi Agama Kristen) Negeri maupun yang dikelola masyarakat Kristen. STAK (Sekolah Tinggi Agama Kristen Negeri) di Indonesia, seperti di beberapa wilayah di Indonesia, yaitu:
1. STAKN di Ambon
2. STAKN di Nusa Tenggara Timur (di Kota Kupang)
3. Ada pula dari Katolik yaitu Sekolah Tinggi Agama Katolik Negeri Kupang.Ada program S1 dan S2.Info Univ Pendidikan Ganesha
3. STAKN Manado
4. STAKN Papua:
Sekolah Tinggi Agama Kristen Protestan Negeri Sentani atau lebih dikenal dengan singkatan:STAKPN Sentani; Sedangkan di Jayapura dikenal dengan: Sekolah Tinggi Agama Kristen Negeri (STAKN) Jaya Pura, didirikan tahun 1995. Ada tiga jurusan atau Program Studi yang diselenggarakan di STAKN Jaya Pura, yaitu: Program Studi Teologi, Program Studi Pendidikan Agama Kristen (PAK); Program STudi Musik Gereja. Jurusan atau Program studi musik gereja masih langka, jika ada yang hendak mengambil musik gereja maka anda dapat mendaftar disana.
5. STAKN Toraja
6. STAKN Tarutung
Dalam bentuk Sekolah Tinggi Teologi (STT), tersebar di setiap propinsi seperti:
1. STT di wilayah DKI Jakarta
1.1. Jakarta Pusat
1.2. Jakarta Barat
1.3. Jakarta Timur
1.4. Jakarta Selatan
1.5. Jakarta Utara
2. Sekolah Tinggi Teologi di wilayah Banten
3. Sekolah Tinggi Teologi di wilayah Jawa Barat
4. Sekolah Tinggi Teologi di wilayah Jawa Tengah
5. Sekolah Tinggi Teologi di wilayah Jawa Timur
6. Sekolah Tinggi Teologi di wilayah Bali
7. Sekolah Tinggi Teologi di Wilayah NTB (Mataram)
8. Sekolah Tinggi Teologi di Sumba Barat dan Sumba Timur, NTT
9. Sekolah Tinggi Teologi di NTT: Kota Kupang, Timor Tengah Selatan (SoE)
10. Sekolah Tinggi Teologi di wilayah Sulawesi Utara
11. Sekolah Tinggi Teologi di wilayah Sulaweis Selatan
12. Sekolah Tinggi Teologi di wilayah Sulawesi Tengah
13. Sekolah Tinggi Teologi di wilayah Papua
14. Sekolah Tinggi Teologi di wilayah Maluku (Ambon)
Sekolah-sekolah tersebut di atas menyelenggarakan pendidikan untuk jenjang S1 dengan tugas akhir membuat Skripsi S.Th. maupun S.Pd. (Sarjana Pendidikan Kristen), dan membuat tesis untuk tingkat Magister Teologi (M.Th.), Magister Pendidikan Kristen (M.Pd.)
Kemudian disertasi untuk tingkat doktoral. gelar yang diperoleh yakni D.Th.
Bagi Anda yang sedang mempersiapkan diri untuk studi S1, S2 dan S3 dalam bidang Pendidikan Kristen, kami informasikan syarat-syarat Pendaftaran Masuk STAKN Program Sarjana secara umum sbb:
1. Mengisi formulir pendaftaran
2. Menyerahkan foto copy ijazah SMU/SMK/Paket C/SMTK yang telah dilegalisir dengan cap basah sebanyak 2 lembar
3. Pas foto ukuran 2x3 dan 3x4
4. Foto Copy Surat SIdi, Surat Baptis (2 lembar)
5. Foto copy Kartu Keluarga
6. Membayar biaya pendaftaran
Syarat Pendaftara Pascasarjana Pendidikan Agama Kristen
1. Lulus S1 Teologi/Pendidikan Agama Kristen dari PT yang terakreditasi
2. Matrikulasi bagi yang non sebidang Teologi/PAK
3. Mengisi Formulir
4. Menyerahkan Salinan Ijazah S1 dan transkrips yang telah dilegalisir cap Basah
5. Surat Keterangan sehat dari dokter
6. Surat Rekomendasi dari Gereja asal mahasiswa
7. Surat rekomendasi sponsor
8. Sertifikat toefel dengan nilai 450
9. Membuat paper mini (tulisan ilmiah) dengan tema PAK dan akan dikembangkan menjadi Tesis. Jumlah halaman 11 halaman
10. IPK 2,75
Untuk Persyaratan Doktor Teologi S3
1. Mengisi formulir pendaftaran program doctoral di bagian pasca sarjana
2. Menyerahkan ijazah S1 dan S2 beserta transkrip nilai akademik yang telah dilegalisir dengan cap basah (bukan foto copy)
3. Memiliki IPK minimal 3,3
4. Mendapat Rekomendasi dari STT pemberi gelar S2 untuk menempuh studi S3
5. Menyerahkan sertifikat TOEFL (International Institutional) dengan skor 500 (diserahkan sebelum disertasi)
6. Membuat dan menyerahkan proposal studi yang terdiri dari alasan, tujuan dan perencanaan studi
7. Menyerahkan pas foto berwarna ukuran 4×6 cm, 3×4 cm dan 2×3 cm masing-masing sebanyak 4 lembar
8. Lulus tes yang diselanggarakan oleh panitia
9. Menyerahkan surat keterangan kesehatan dari dokter.
